Fiocruz / UNIR · AutoDock 4.2 EPDB
A energia desta pose, com os termos que o AutoDock realmente calcula.
eAutoDock avalia um complexo ligante–receptor na geometria que você já tem. Não é docking com busca conformacional: é rescoring EPDB, com caixa derivada do ligante, hidrogênios, Ki em unidade única e um endereço permanente para o resultado.
O que entra
PDB do receptor e do ligante, um complexo para fatiar, ou um ID do PDB. SDF, MOL2 e SMILES são convertidos; o pH opcional protona com Open Babel.
O que sai
ΔG, decomposição, Ki/Kd com unidade inteligível, pKi, eficiência de ligante, mapa de H-bonds e contatos, viewer 3D com a caixa, e o parágrafo de métodos.
O que não faz
Não procura poses (LGA), não roda Vina, não faz virtual screening. Se a pose estiver fora da caixa ou em choque estérico, o cálculo para.
